美国启用TOP500最强超算寻求新冠病毒药物

西贝网 20200323

  • 药物研发
  • 超算
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Summit超算位于美国橡树岭国家实验室，2017年底落成，从2018年上半年开始一直位列TOP500超算第一，终结了中国天河2号/太湖之光超算保持的10连冠，不出意外的话今年的2次TOP500冠军还是它。

我们知道，COVID-19新冠病毒目前还没有特效药，全球都在加紧研发对应的药物及疫苗。为了加快药物研发，美国启用了目前全球最强的超算Summit，每秒浮点性能可达20亿亿次。Summit超算位于美国橡树岭国家实验室，2017年底落成，从2018年上半年开始一直位列TOP500超算第一，终结了中国天河2号/太湖之光超算保持的10连冠，不出意外的话今年的2次TOP500冠军还是它。

Summit超算使用了IBM Power 9处理器及NVIDIA的Tesla V100加速卡，每个节点2组22核Power 9处理器及6组Tesla V100加速卡，单节点性能42TFLOPS，峰值浮点性能200PFLOPS（20亿亿次），Linpack性能也有143PFLOPS。

在超算的应用领域中，分子动力学是最需要强大运算性能的研究了，此前Summit超算也跑过老年痴呆、阿片类药物成瘾之类的运算，这次研究人员用它来模拟新冠病毒与不同化合物的反应。

据报道，这项研究已经针对8000多种有可能跟病毒蛋白结合的物质做了模拟测试，Summit超算筛选出77个可能有用的化合物，并根据测试结果做了排序。

不过超算的测试结果现在还只是参考，真正确定药物是否有效还需要很复杂的过程。

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